2009年该局共检验出口食用菌及其制品８５８０．７吨、７５６１．４万美元，同比增长３４．４８％和７８．２４％，继２００７年、２００８年出口大幅下滑后首次出现大幅增长。
福建省食用菌主要出口日本、美国、泰国、韩国、新加坡、越南、墨西哥等，其中出口日本货值占食用菌出口总货值的６７．９％，增幅达６８．９％，输美食用菌货值增长２０４．１％。福建省的香菇、黑木耳、蘑菇、银耳等主要食用菌品种出口量同比均有较大增长。
分析显示，出现增长的主要原因一是政府出台提高出口退税率等激励政策，促进了产品扩大出口。二是传统的日本市场得到恢复，同时企业积极开拓新兴市场，特别是北美自由贸易区市场取得突破。三是福建省检验检疫部门出台了系列帮扶措施，帮助企业加强原料基地管理，提高了产品质量。
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